Su'esu'ega fa'amatalaga lautele

O faʻamatalaga i luga ole laina ole SARS-CoV-2 ma le aso na ave ai le faʻataʻitaʻiga mai faʻasologa na maua mai Chile na maua mai le Consorcio Genomas CoV2 saite o loʻo maua ile https://auspice.cov2.cl/ncov/chile-global. O fa'amaumauga o tui na maua mai i fa'amatalaga lautele mai le Matagaluega o Saienisi, Tekonolosi, Poto ma Fa'afouina o lo'o maua ile https://github.com/MinCiencia/Datos-COVID19 (Oloa 83).

Su'ega fa'ama'i

O faʻamaʻi faʻailoga faʻapipiʻi o loʻo feaveaʻi faʻamaʻi eseese o le SARS-CoV-2 na saunia e pei ona matou faʻamatalaina muamua.¹². Fa'apuupuu, HIV-1-fa'avae SARS-CoV-2 pseudotypes na gaosia i sela HEK293T e ala i le fa'aliliuina o le pNL4.3-ΔEnv-Luc fa'atasi ma le pCDNA-SARS-CoV-2 Spike coding vector i le 1:1 molar ratio. Plasmids o lo'o fa'ailogaina se codon-optimized spike e leai se 19 amino acids mulimuli o le C-terminal end (SΔ19) ua iloa e aloese mai le taofia i le endoplasmic reticulum.¹² na maua e ala i le fa'atupuina o kenera po'o le fa'asologa o suiga i luga ole laiga (GeneScript) ma o lo'o i ai suiga nei: gafa A (fa'asologa fa'asologa), gafa B (D614G), gafa B.1.1.7 (Δ69-70, Δ144, N501Y, A570D, D614G, P681H, T716I, S982A, D1118H), gafa P.1 (L18F, T20N, P26S, D138Y, R190S, K417T, E484K, N501Y, D614G, H655Y, T1027, T37, T75, T76, T246, T252 452, L490Q, F614S, D859G, T3,000N). O sauniuniga pseudotype taʻitasi na faʻamamaina e ala i le centrifugation i le 1 rpm i le vevela o le potu, faʻatusatusa i le faʻaaogaina o le HIV-24 Gag p50 Quantikine ELISA Kit (R&D Systems), faʻapipiʻiina i le 80% fetal bovine serum (Sigma-Aldrich) ma teuina i le -1 °C seia oʻo. fa'aoga. Eseese aofaiga o pseudotyped viruses (e pei ona fuafuaina e le maualuga o le HIV-24 p2 protein) na faʻaaogaina e aʻafia ai sela HEK-ACE48 ma 96 itula mulimuli ane, na fuaina ai le gaioiga o le luciferase firefly e faʻaaoga ai le Luciferase Assay Reagent (Promega) i se Glomax XNUMX Microplate luminometer (Promega).

Su'ega fa'aleaogaina

O su'esu'ega fa'aleaogaina fa'ama'i pseudotyped na fa'atinoina e pei ona ta'ua muamua¹². I se faapuupuuga, o faʻasologa faʻasolosolo o faʻataʻitaʻiga plasma (1: 4 i le 1: 8748) na saunia i le DMEM ma le 10% fetal bovine serum ma faʻapipiʻiina i le 5 ng o p24 o siama pseudotyped taʻitasi i le 1h i le 37 °C ona sosoo ai lea, 1 × 10.⁴ o sela HEK-ACE2 ua faaopoopo i vaieli taitasi. HEK293T sela (e le o fa'aalia le ACE2) fa'apipi'iina i le pseudotyped virus (laina A) na fa'aaogaina e fai ma pule le lelei. O sela na faʻaumatia 48 itula mulimuli ane, ma na fuaina le gaioiga o le luciferase firefly e faʻaaoga ai le Luciferase Assay Reagent (Promega) i le Glomax 96 Microplate luminometer (Promega). O le pasene o le neutralization mo faʻafefeteina taʻitasi na faʻatatauina ma le ID50 o faʻataʻitaʻiga taʻitasi na fuafuaina e faʻaaoga ai le GraphPad Prism version 9.0.1.

Suʻesuʻega faʻamaumauga

Sa fa'atinoina su'esu'ega fa'amaumauga i le fa'aogaina o le GraphPad Prism software version 9.1.2. O le tele o fa'atusatusaga o vaega mo le fa'afitia o le antibody titers (NAbTs) e fa'asaga i se vaega o fa'ama'i pseudotyped SARS-CoV-2 fa'apea fo'i ma fa'atusatusaga o tali a le NAbs e ala i feusuaiga ma tulaga asu na fa'atinoina e fa'aaoga ai se su'ega saini saini a Wilcoxon. Fa'ailoga suiga na fa'atatauina o le 'ese'esega o fa'ailoga fa'atusa fa'atusa ile ID₅₀ pe a faatusatusa i le siama o le Wild type pseudotyped virus. Su'esu'ega fa'atasi i le va o NAbTs ma le matua po'o le BMI na fa'atinoina ile fa'aogaina ole su'ega a Spearman. E tasi le auala ANOVA ma Tukey's su'ega fa'atusatusaga e tele na faia mo su'esu'ega fa'afuainumera o fa'ama'i pipisi. O le tau o le p ≤0.05 na manatu e taua tele.

Talosaga faʻamaonia

O le suʻesuʻega o suʻesuʻega na faʻamaonia e le Komiti o Amio Taualoa a le Faculty of Medicine i Universidad de Chile (Projects N ° 0361-2021 ma N ° 096-2020) ma Clínica Santa Maria (Project N°132604-21). Na sainia uma e le au foaʻi le maliega faʻamaonia, ma o latou faʻataʻitaʻiga na le iloa.

A'afiaga o suiga fa'apipi'i i le Lambda ese'ese i fa'ama'i pipisi ma fa'aletonu tali fa'ama'i

O se auiliiliga o 3695 faasologa mai Chile na teuina i le GISAID e pei o Iuni 24^th O le 2021 o loʻo faʻaalia ai le faʻaalia manino o le SARS-CoV-2 variants Gamma ma Lambda i le taimi o le tolu masina mulimuli, faʻatasi, mo le 79% o faʻasologa uma.

O le mea e malie ai, o lenei vaitau na faʻaalia i le tele o tui puipui lea e 65.6% o le faitau aofaʻi o tagata (18 tausaga ma matutua atu) na mauaina se polokalame tui atoatoa e pei o Iuni 27.^th 2021

Talu ai ona o le 78.2% o tagata na tui i se polokalame atoa na mauaina le tui puipuia o le virus CoronaVac mai le Sinovac Biotech, na matou saili e suʻesuʻe le aʻafiaga o suiga faʻapipiʻi o loʻo i ai i le Lambda i luga o le malosi faʻaleagaina o antibodies e mafua mai i lenei tui.

Mo lenei mea, na matou gaosia ai le HIV-1-based SARS-CoV-2 pseudotyped viruses o loʻo tauaveina le polotini spike mai le laina faʻasino Wuhan-1 (ituaiga vao; gafa A), le suiga o le D614G (laina B), ma le Alpha (laina B). .1.1.7), Gamma (tupuga P.1) ma Lambda (gafa C.37) eseese.

I le taimi o sauniuniga o le siama, sa matou matauina pea lava pea o sela na aafia i le virus pseudotyped o loʻo tauaveina le Lambda spike na maua ai le maualuga maualuga o le bioluminescence pe a faʻatusatusa i le D614G mutant poʻo le Alpha ma le Gamma variants e faʻaalia ai le faʻateleina o faʻamaʻi pipisi e le Lambda spike protein.

Ata 1.Fa'ama'i pipisi e fa'atatau i polotini spike eseese.

(A) Fa'ata'ita'iga fa'ata'ita'iga o le polotini spike SARS-CoV-2 ma le 'ese'ese o lo'o fa'aogaina i lenei su'esu'ega. O gafa o lo'o fa'ailoa i puipui. RBD, vaega faʻapipiʻi tali, CM; si'usi'u cytoplasmic.

(B) Titration o pseudotypes o gafa ta'itasi e fa'aaoga ai le aofa'i tutusa o le HIV-1 p24. O le gaioiga o le firefly luciferase na fuaina e pei o iunite luminescence (RLU) ile 48 itula pe a maeʻa faʻamaʻi. O le averesi ma le SD sa fuafuaina mai se fa'ata'ita'iga fa'atolu.

Na sosoo ai, na matou faʻaogaina faʻamaʻi pseudotyped o loʻo taʻua i luga e faia ai suʻesuʻega faʻaituau e faʻaaoga ai faʻataʻitaʻiga 79 plasma mai tagata faigaluega soifua maloloina soifua maloloina mai Universidad de Chile ma Clínica Santa María i Santiago, Chile.

Na matou le aofia ai faʻataʻitaʻiga 4 ona e le mafai ona matou faʻatatauina se ID50 titer. Mai faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga, 73% e fetaui ma tamaʻitaʻi, vaeluagalemu tausaga 34 tausaga (IQR 29 - 43) ma le faʻasologa o le tino (BMI) o le 25 (IQR 22.7 - 27). E 20.5% o i latou na auai na fa'ailoa mai o ni tagata ulaula malosi a'o tumau le tuipuipui. O fa'ata'ita'iga na maua mai ile vaeluaga ole 95 aso (IQR 76 - 96) ina ua mae'a le tui lona lua ole tui CoronaVac.

Na matou matauina o le faʻaitiitia o le siama faʻailoga o loʻo tauaveina le Wild type spike protein na mafua ai le 50% faʻafefe faʻafefe (ID₅₀) o lona uiga o le titer o le 191.46 (154.9 - 227.95, 95% CI,), aʻo 153.92 (115.68 - 192.16, 95% CI), 124.73 (86.2 - 163.2, 95% CI), 104.57% CI, 75.02% CI, 134.11% CI. ) ma le 95 (78.75 - 49.8, 107.6% CI) mo faʻamaʻi pseudotyped o loʻo tauaveina le polotini spike mai le D95G mutant poʻo le Alpha, Gamma ma Lambda variants, faasologa.

Na matou matauina foi o le fa'ailoga fa'atusa o le ID₅₀ titers na faʻaititia i se vaega o le 3.05 (2.57 - 3.61, 95% CI) mo le pseudotyped virus o loʻo tauaveina le Lambda spike, 2.33 (1.95 - 2.80, 95% CI) mo le Gamma spike, 2.03 (1.71 - 2.41%), . mo le Alpha spike ma le 95 (1.37 - 1.20, 1.55% CI) mo le D95G spike pe a faatusatusa i le Wild type spike.

Leai se faʻamaopoopoina i le va o feusuaiga, tausaga, faʻasologa o le tino-mass (BMI) poʻo le tulaga o le asu ma le faʻaleagaina o antibody titers na matauina i la matou suʻesuʻega.

Ata 2.Ole su'ega ole fa'aogaina ole plasma samples mai tui CoronaVac

(A) Suiga i le 50% fa'aitu'u fa'aitu'u (ID₅₀) i fa'ata'ita'iga o le plasma mai le to'a 75 o lo'o mauaina le tui puipuia o le CoronaVac e fa'asaga i le D614G (laina B), Alpha (laina B.1.1.7),

Gamma (laina P.1) ma Lambda (ga'au C.37) ese'ese pe a fa'atusatusa ile fa'ama'i fa'ama'i. O fa'ai'uga o lo'o fa'aalia e pei o le 'ese'esega o fa'ai'uga o fa'ata'ita'iga fa'atusa. P tau mo le faʻatusatusaga o le ID₅₀ e fa'atatau ile su'ega saini a Wilcoxon.

(B) Fa'ailoga pusa o lo'o fa'aalia ai le vaeluagalemu ma le vaeluagalemu (IQR) ole ID₅₀ mo virus fa'ailoga ta'itasi. Fa'ailoga suiga o lo'o fa'aalia e pei o le ese'esega o le fa'ailoga fa'atusa i le ID₅₀ pe a faatusatusa i latou mo le Wild type pseudotyped virus. Na fa'atinoina su'esu'ega fa'amauina i le fa'aaogaina o le su'ega Wilcoxon matched-pair signed-rank.

Faʻatasi, o matou faʻamaumauga na faʻaalia ai o le spike protein o le suiga fou o le fiafia o Lambda, o loʻo faʻasalalau i Chile ma atunuu i Saute Amerika, o loʻo faʻaalia ai suiga e faʻaalia ai le faʻateleina o faʻamaʻi ma le mafai ona sola ese mai le faʻaleagaina o antibodies na mafua mai e CoronaVac.